Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP3Q96DZ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP3Q96DZ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIP3Q96DZ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms