Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB2Q96DC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUB2Q96DC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB2Q96DC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms