Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4CQ96CF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHMP4CQ96CF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHMP4CQ96CF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4CQ96CF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms