Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCE1Q969G3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCE1Q969G3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCE1Q969G3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCE1Q969G3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCE1Q969G3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms