Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGDQ93099 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGDQ93099 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGDQ93099 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGDQ93099 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGDQ93099 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HGDQ93099 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGDQ93099 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGDQ93099 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGDQ93099 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGDQ93099 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGDQ93099 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGDQ93099 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGDQ93099 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGDQ93099 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGDQ93099 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGDQ93099 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGDQ93099 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGDQ93099 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGDQ93099 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGDQ93099 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGDQ93099 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGDQ93099 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGDQ93099 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGDQ93099 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGDQ93099 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HGDQ93099 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HGDQ93099 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HGDQ93099 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGDQ93099 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HGDQ93099 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HGDQ93099 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HGDQ93099 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HGDQ93099 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HGDQ93099 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGDQ93099 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HGDQ93099 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms