Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SSMEM1Q8WWF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSMEM1Q8WWF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSMEM1Q8WWF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSMEM1Q8WWF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSMEM1Q8WWF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms