Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC148Q8NFR7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC148Q8NFR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC148Q8NFR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC148Q8NFR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms