Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FSIP1Q8NA03 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FSIP1Q8NA03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSIP1Q8NA03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms