Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYBPQ8N488 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RYBPQ8N488 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms