Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP4Q8N3C7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP4Q8N3C7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP4Q8N3C7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms