Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLF2Q8IX21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLF2Q8IX21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLF2Q8IX21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF2Q8IX21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms