Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALYREFQ86V81 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALYREFQ86V81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALYREFQ86V81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALYREFQ86V81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms