Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP54Q7Z3B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP54Q7Z3B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP54Q7Z3B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms