Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT13Q7L8C5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT13Q7L8C5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT13Q7L8C5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT13Q7L8C5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT13Q7L8C5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms