Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCARA5Q6ZMJ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCARA5Q6ZMJ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARA5Q6ZMJ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms