Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASP12Q6UXS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP12Q6UXS9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP12Q6UXS9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms