Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL35Q6PF15 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL35Q6PF15 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL35Q6PF15 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms