Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKN3Q6P5Z2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN3Q6P5Z2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN3Q6P5Z2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms