Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF6Q6KF10 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF6Q6KF10 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF6Q6KF10 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms