Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC19Q6DKK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC19Q6DKK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC19Q6DKK2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms