Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FOCADQ5VW36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOCADQ5VW36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FOCADQ5VW36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FOCADQ5VW36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms