Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q3C1V9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q3C1V9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q3C1V9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q3C1V9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q3C1V9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3C1V9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3C1V9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3C1V9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3C1V9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3C1V9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3C1V9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3C1V9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3C1V9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3C1V9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3C1V9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3C1V9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3C1V9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3C1V9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3C1V9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3C1V9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3C1V9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3C1V9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3C1V9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3C1V9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3C1V9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3C1V9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3C1V9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3C1V9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q3C1V9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q3C1V9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q3C1V9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3C1V9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3C1V9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3C1V9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3C1V9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3C1V9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3C1V9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3C1V9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3C1V9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3C1V9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3C1V9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3C1V9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3C1V9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3C1V9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3C1V9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3C1V9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3C1V9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3C1V9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3C1V9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3C1V9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3C1V9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3C1V9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3C1V9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Q3C1V9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3C1V9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3C1V9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3C1V9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3C1V9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3C1V9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3C1V9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms