Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UVSSAQ2YD98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UVSSAQ2YD98 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UVSSAQ2YD98 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms