Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRED3Q2MJR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRED3Q2MJR0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms