Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA9Q16795 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA9Q16795 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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