Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF9Q16594 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TAF9Q16594 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF9Q16594 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TAF9Q16594 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TAF9Q16594 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF9Q16594 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF9Q16594 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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