Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms