Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPE65Q16518 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPE65Q16518 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPE65Q16518 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPE65Q16518 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPE65Q16518 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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