Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC22D1Q15714 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC22D1Q15714 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC22D1Q15714 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms