Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HMGN3Q15651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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