Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIP11Q15643 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIP11Q15643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIP11Q15643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIP11Q15643 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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