Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SURF1Q15526 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF1Q15526 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF1Q15526 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SURF1Q15526 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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