Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH1Q15438 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYTH1Q15438 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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