Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NKX1-1Q15270 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NKX1-1Q15270 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NKX1-1Q15270 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms