Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD1Q15011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERPUD1Q15011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD1Q15011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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