Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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