Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF235Q14590 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF235Q14590 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF235Q14590 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF235Q14590 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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