Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSHL1Q14406 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSHL1Q14406 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSHL1Q14406 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSHL1Q14406 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms