Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX39BQ13838 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39BQ13838 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39BQ13838 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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