Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF4BQ13523 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF4BQ13523 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF4BQ13523 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF4BQ13523 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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