Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC4Q13426 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XRCC4Q13426 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC4Q13426 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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