Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1BQ13112 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1BQ13112 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHAF1BQ13112 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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