Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECH1Q13011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECH1Q13011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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