Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TROQ12816 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TROQ12816 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TROQ12816 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TROQ12816 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TROQ12816 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TROQ12816 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TROQ12816 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TROQ12816 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TROQ12816 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TROQ12816 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TROQ12816 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TROQ12816 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TROQ12816 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TROQ12816 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TROQ12816 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TROQ12816 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TROQ12816 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TROQ12816 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TROQ12816 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TROQ12816 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TROQ12816 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TROQ12816 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TROQ12816 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TROQ12816 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
TROQ12816 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TROQ12816 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TROQ12816 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TROQ12816 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TROQ12816 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TROQ12816 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TROQ12816 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TROQ12816 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TROQ12816 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TROQ12816 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TROQ12816 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TROQ12816 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TROQ12816 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TROQ12816 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TROQ12816 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TROQ12816 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TROQ12816 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TROQ12816 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TROQ12816 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TROQ12816 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TROQ12816 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TROQ12816 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TROQ12816 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TROQ12816 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TROQ12816 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TROQ12816 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TROQ12816 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TROQ12816 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
TROQ12816 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TROQ12816 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TROQ12816 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TROQ12816 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TROQ12816 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TROQ12816 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TROQ12816 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TROQ12816 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TROQ12816 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TROQ12816 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
TROQ12816 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TROQ12816 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TROQ12816 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TROQ12816 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TROQ12816 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TROQ12816 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TROQ12816 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
TROQ12816 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TROQ12816 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TROQ12816 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TROQ12816 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TROQ12816 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TROQ12816 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TROQ12816 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TROQ12816 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TROQ12816 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
TROQ12816 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TROQ12816 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TROQ12816 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TROQ12816 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
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