Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE4DQ08499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4DQ08499 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4DQ08499 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4DQ08499 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms