Protein–RNA interactions for Protein: Q08417

RSB1, Sphingoid long-chain base transporter RSB1, yeastyeast

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RSB1Q08417 ADH6YMR318C 1083 nt7.5□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 PRE2YPR103W 864 nt7.5□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 ERR3YMR323W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 ERR1YOR393W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 ERR2YPL281C 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 UME1YPL139C 1383 nt7.49□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 URA1YKL216W 945 nt7.49□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 MSI1YBR195C 1269 nt7.49□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 HDA1YNL021W 2121 nt7.49□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 NUP57YGR119C 1626 nt7.49□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 DST1YGL043W 930 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 STS1YIR011C 960 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 TES1YJR019C 1050 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 YNL295WYNL295W 1575 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 MNN9YPL050C 1188 nt7.48□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 YNL040WYNL040W 1371 nt7.47□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 YBL111CYBL111C 2004 nt7.47□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 MAK32YCR019W 1092 nt7.47□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 LYS12YIL094C 1116 nt7.47□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 YOX1YML027W 1158 nt7.47□□□□□ -1.21
RSB1Q08417 YLR036CYLR036C 612 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YLR311CYLR311C 348 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YMR114CYMR114C 1107 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YMR253CYMR253C 1245 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PTH2YBL057C 627 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PDC5YLR134W 1692 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 MAM3YOL060C 2121 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 ECM10YEL030W 1935 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YKR023WYKR023W 1593 nt7.46□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 CKB1YGL019W 837 nt7.45□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PEX12YMR026C 1200 nt7.45□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YPQ1YOL092W 927 nt7.45□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 FRT1YOR324C 1809 nt7.45□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 MAS2YHR024C 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 CKI1YLR133W 1749 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PMA2YPL036W 2844 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 TPO1YLL028W 1761 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PSA1YDL055C 1086 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 GGC1YDL198C 903 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 RAI1YGL246C 1164 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 AVL9YLR114C 2295 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 HRB1YNL004W 1365 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 RUP1YOR138C 2016 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PEX28YHR150W 1740 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 SVF1YDR346C 1446 nt7.44□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YGL081WYGL081W 963 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 CYS3YAL012W 1185 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 SED5YLR026C 1023 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YLR030WYLR030W 792 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 ELP6YMR312W 822 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 INP54YOL065C 1155 nt7.43□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 CDC3YLR314C 1563 nt7.42□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 PTC7YHR076W 1032 nt7.42□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YJL144WYJL144W 315 nt7.42□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YIL092WYIL092W 1902 nt7.41□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 MBF1YOR298C-A 456 nt7.41□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YPL067CYPL067C 597 nt7.41□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 SPS1YDR523C 1473 nt7.41□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 AQR1YNL065W 1761 nt7.41□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 CDA1YLR307W 906 nt7.4□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.4□□□□□ -1.22
RSB1Q08417 POB3YML069W 1659 nt7.38□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.38□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 CST26YBR042C 1194 nt7.38□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 AOS1YPR180W 1044 nt7.38□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 MTC6YHR151C 1581 nt7.37□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 OSM1YJR051W 1506 nt7.37□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 TIF34YMR146C 1044 nt7.37□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 MCP1YOR228C 909 nt7.37□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 snR34snR34 203 nt7.37□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 PRY2YKR013W 990 nt7.36□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 YNR048WYNR048W 1182 nt7.36□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 YKR018CYKR018C 2178 nt7.36□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 MAL31YBR298C 1845 nt7.36□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 PPZ2YDR436W 2133 nt7.36□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 CDS1YBR029C 1374 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 GNA1YFL017C 480 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 HAM1YJR069C 594 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 PUS4YNL292W 1212 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 ZIM17YNL310C 525 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 YOL079WYOL079W 399 nt7.35□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 NEM1YHR004C 1341 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 CTF3YLR381W 2202 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 PIL1YGR086C 1020 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 SNA3YJL151C 402 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 DSC3YOR223W 879 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 YPT10YBR264C 600 nt7.34□□□□□ -1.23
RSB1Q08417 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 YHR033WYHR033W 1272 nt7.33□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 ARC19YKL013C 516 nt7.33□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 STD1YOR047C 1335 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 ISR1YPR106W 1332 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 TRR2YHR106W 1029 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 AIM46YHR199C 933 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 UBC12YLR306W 567 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 YMR074CYMR074C 438 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 PRS4YBL068W 981 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 YBL113CYBL113C 2379 nt7.32□□□□□ -1.24
RSB1Q08417 SKP1YDR328C 585 nt7.31□□□□□ -1.24
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