Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC63Q05C16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC63Q05C16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC63Q05C16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC63Q05C16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms