Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTK2Q05397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTK2Q05397 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTK2Q05397 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTK2Q05397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms