Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 APE4YHR113W 1473 nt8.39□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 SAL1YNL083W 1485 nt8.39□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 LEO1YOR123C 1395 nt8.38□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 YAH1YPL252C 519 nt8.38□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 TOP3YLR234W 1971 nt8.38□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 CRH1YGR189C 1524 nt8.38□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 ERG24YNL280C 1317 nt8.36□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 ADE16YLR028C 1776 nt8.36□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 PMT1YDL095W 2454 nt8.36□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 YDR387CYDR387C 1668 nt8.36□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 DRE2YKR071C 1047 nt8.35□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 MRPS18YNL306W 654 nt8.35□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 MET8YBR213W 825 nt8.35□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 SNF7YLR025W 723 nt8.34□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 TAF9YMR236W 474 nt8.34□□□□□ -1.07
SYF1Q04048 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.33□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 DMC1YER179W 1005 nt8.33□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 MIM1YOL026C 342 nt8.33□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 YOL099CYOL099C 492 nt8.33□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 LSC1YOR142W 990 nt8.33□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 ASF1YJL115W 840 nt8.31□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 AFG3YER017C 2286 nt8.3□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 YMR252CYMR252C 405 nt8.3□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 DUR3YHL016C 2208 nt8.29□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 YIP4YGL198W 708 nt8.29□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 NAS6YGR232W 687 nt8.29□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 NTG2YOL043C 1143 nt8.29□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 HBS1YKR084C 1836 nt8.29□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.28□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 GCG1YER163C 699 nt8.28□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 NUP49YGL172W 1419 nt8.28□□□□□ -1.08
SYF1Q04048 FMO1YHR176W 1299 nt8.27□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 RTC2YBR147W 891 nt8.27□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 RDR1YOR380W 1641 nt8.27□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YDR327WYDR327W 327 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 SNA3YJL151C 402 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YLR463CYLR463C 552 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 snR4snR4 186 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 PDC5YLR134W 1692 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 DIA4YHR011W 1341 nt8.26□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YLL056CYLL056C 897 nt8.25□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 OSW2YLR054C 2175 nt8.25□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 RPL43AYPR043W 279 nt8.24□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 RRP9YPR137W 1722 nt8.23□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YGL102CYGL102C 429 nt8.23□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 ERG27YLR100W 1044 nt8.23□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt8.23□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 YLL058WYLL058W 1728 nt8.23□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 HNM1YGL077C 1692 nt8.22□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 TPI1YDR050C 747 nt8.22□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 NSG2YNL156C 900 nt8.22□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 RSC9YML127W 1746 nt8.22□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 ICP55YER078C 1536 nt8.22□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 MET30YIL046W 1923 nt8.21□□□□□ -1.09
SYF1Q04048 CDC7YDL017W 1524 nt8.21□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YNL190WYNL190W 615 nt8.21□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 LAS17YOR181W 1902 nt8.21□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 MSC3YLR219W 2187 nt8.2□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YCR049CYCR049C 447 nt8.2□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 TFG2YGR005C 1203 nt8.2□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 PGI1YBR196C 1665 nt8.2□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 DUS3YLR401C 2007 nt8.2□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 MED6YHR058C 888 nt8.19□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YBR113WYBR113W 483 nt8.19□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YNL092WYNL092W 1203 nt8.18□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 FSF1YOR271C 984 nt8.18□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 RUP1YOR138C 2016 nt8.18□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 CDC1YDR182W 1476 nt8.18□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 PMA2YPL036W 2844 nt8.17□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 RNH201YNL072W 924 nt8.17□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 ERG8YMR220W 1356 nt8.17□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YLR173WYLR173W 1827 nt8.17□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 OM45YIL136W 1182 nt8.16□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YML018CYML018C 1182 nt8.16□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YBL113CYBL113C 2379 nt8.16□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 ADE2YOR128C 1716 nt8.16□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 RTG2YGL252C 1767 nt8.15□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 PRI1YIR008C 1230 nt8.15□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YKL102CYKL102C 306 nt8.15□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YAL045CYAL045C 309 nt8.15□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 YMR122CYMR122C 375 nt8.15□□□□□ -1.1
SYF1Q04048 HIS1YER055C 894 nt8.14□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 TDH2YJR009C 999 nt8.14□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 YKL147CYKL147C 618 nt8.14□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 CBK1YNL161W 2271 nt8.14□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 MAM3YOL060C 2121 nt8.14□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 YDR187CYDR187C 519 nt8.12□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 YGL260WYGL260W 231 nt8.12□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 SMX3YPR182W 261 nt8.12□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 TCB1YOR086C 3561 nt8.12□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 GPD2YOL059W 1323 nt8.11□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 ERR1YOR393W 1314 nt8.11□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 ERR2YPL281C 1314 nt8.11□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 TSR2YLR435W 618 nt8.11□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 MLS1YNL117W 1665 nt8.11□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 GCD11YER025W 1584 nt8.1□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 ECM10YEL030W 1935 nt8.1□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 GTS1YGL181W 1191 nt8.1□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 REC107YJR021C 945 nt8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.3 ms