Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ROR1Q01973 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ROR1Q01973 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ROR1Q01973 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms