Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL1Q00532 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL1Q00532 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL1Q00532 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL1Q00532 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms